ישנם שני סוגים עיקריים של סכנות ברק: פגיעות ברק ישירות ומכות ברק עקיפות.
הגנה מפני פגיעות ברק ישירות: הגדר מוליכים מתכתיים להגנה מפני ברקים על בניינים גבוהים, כולל מוטות ברקים, חגורות הגנה מפני ברקים והתקני הארקה, שיכולים לשחרר את מטען ענן סופת הרעם העצום. לא ניתן להגן על כל הציוד החשמלי במערכת הפוטו-וולטאית מפני פגיעות ברק ישירות.
הגנה מפני ברקים אינדוקציה: למערכת הפוטו-וולטאית יש מודולי הגנה מפני ברקים בציוד חשמלי כגון קופסאות קומבינרים וממירים להגנה מפני פגיעות ברק עקיפות. למהפך יש הגנת ברקים משנית ומיגון ברקים שלישוני. הגנת הברקים המשנית מאמצת מודול הגנת ברקים, המשמש בדרך כלל בתחנות כוח פוטו-וולטאיות בינוניות וגדולות. אין בניינים גבוהים מסביב לתחנת הכוח. הגנת ברקים ברמה השלישית מאמצת התקני הגנה מפני ברקים. הוא משמש לתחנת כוח פוטו-וולטאית קטנה לבית, ויש מבנים גבוהים מסביב לתחנת הכוח.
מערכות ייצור חשמל פוטו-וולטאיות מבוזרות מצוידות בהתקני הגנה מפני ברקים, כך שאין צורך לנתק אותן במזג אוויר רגיל של ברקים. אם יש סופת רעמים חזקה, מומלץ לנתק את מתג ה-DC של המהפך או קופסת המשלב, ולנתק את חיבור המעגל עם המודולים הפוטו-וולטאיים, כדי למנוע את הנזק שנגרם מברק האינדוקציה.
על צוות התפעול והתחזוקה לבדוק בדרך כלל את מתקני ההגנה מפני ברקים כדי להבטיח את הפעולה הרגילה של מסוף הברקים, המוליך למטה ומערכת ההארקה, לוודא שערך ההתנגדות לקצר של מערכת הארקת הגנת ברקים הוא מתחת ל-4 אוהם, ובאופן קבוע. בדוק את הביצועים של מודול ההגנה מפני ברקים בציוד. מנע תקלות, כך תוכל להבטיח שהציוד לא ייפגע במהלך סופת רעמים.